Os hotéis boutique em San Diego combinam design arrojado, localização estratégica e serviços personalizados. Situados principalmente nos bairros Gaslamp Quarter e Coronado, esses hotéis oferecem piscinas na cobertura, restaurantes premiados e vista para a baía. As diárias variam de US$ 150 a US$ 400, dependendo da temporada e do nível de exclusividade. O viajante pode esperar quartos com decoração contemporânea, acesso a rooftops com bares e proximidade a atrações como Petco Park e o Centro de Convenções.
Entre os destaques, o Hotel Del Coronado, da Curio Collection, é um resort histórico à beira-mar com praia privativa e spa. O Hard Rock Hotel San Diego, no coração do Gaslamp, oferece piscina na cobertura e ambiente musical. Já o Hilton San Diego Bayfront, de frente para a baía, conta com spa e área infantil. O Hotel Indigo no Gaslamp Quarter possui restaurante com vista para o Petco Park, enquanto o Andaz San Diego, da Hyatt, surpreende com cobertura gastronômica e cabanas à beira da piscina. Cada um atende a diferentes perfis: famílias, casais ou viajantes a negócios.