Paraty oferece uma seleção de hotéis boutique que combinam conforto, história e design. Essas pousadas e inns estão localizadas no centro histórico ou em bairros residenciais tranquilos, com fácil acesso às praias e ao centro. Os hóspedes podem esperar piscinas ao ar livre, saunas, cafés da manhã completos e estacionamento gratuito. Os preços variam de moderados a premium, dependendo da localização e das amenidades. Para quem busca imersão cultural, o período da Festa Literária Internacional (FLIP) é ideal, mas exige reserva antecipada.
Entre as opções com avaliações excelentes, destaca-se o Sandi Hotel, com nota 94, que oferece business center, hammam e estrutura para eventos. A Pousada Literária de Paraty, nota 92, é anfitriã oficial da FLIP e possui uma biblioteca com mais de 1.500 livros. Para famílias, a Pousada Eclipse Paraty e a Pousada Paisagem oferecem áreas de lazer e jardins. Já a Pousada Laguna Blue, em bairro nobre, proporciona vista para as montanhas. A Pousada L'Essence encanta com jardim privativo e hidromassagem. Todas oferecem café da manhã incluso e Wi-Fi gratuito.