Guarujá oferece diversas opções de hotéis baratos, perfeitos para quem busca curtir as praias sem estourar o orçamento. As diárias em baixa temporada começam em torno de R$ 150, podendo variar conforme a localização e os serviços incluídos. Os bairros de Enseada e Pitangueiras concentram a maior parte desses hotéis, com fácil acesso à orla, bares e restaurantes. Entre as comodidades mais comuns estão café da manhã, Wi-Fi gratuito e estacionamento, além de piscina em várias unidades.
Entre os mais bem avaliados, o Charme Hotel Guarujá Frente Mar (nota 8,6) se destaca com serviço de barraca e cadeira na Praia da Enseada, ideal para famílias. Já o Grand Hotel Guarujá (nota 8,6) fica de frente para a Praia das Pitangueiras, com quartos com vista para o mar. O Hotel Costa Balena (nota 8,8) agrada quem busca lazer, com piscinas coberta e ao ar livre, sauna e spa. Para quem prefere um ambiente mais tranquilo, a Pousada Suites Enseada Guarujá (nota 9,1) oferece acomodações com cozinha compacta e estacionamento gratuito.